הפרדה של שומן ממי גבינה דומה מאוד לתהליך הפרדה של שומן מחלב. מי גבינה מכילים כמויות קטנות של שומן בדר״כ בין 0.7% לבין- 0.15% ותהליך ההפרדה יותר קל מתהליך הפרדת שומן מחלב.
בשלב העיבוד הטמפרטורה נעה סביב 30 מעלות ו-40 מעלות צלסיוס. ע״י שטיפה במים שומרים על יעילות הפרדה גבוהה.
